MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 7867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016908	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016908	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016908	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016908	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016908	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016908	T	7	7	6326	6332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016908	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016908	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016908	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016908	TCT	2	6	7693	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016908	AAT	2	6	7736	7741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016908	T	7	7	7790	7796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016908	GCT	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016908	GAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016908	CAA	3	9	7849	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016908	TA	3	6	8947	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016908	TAT	2	6	8964	8969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016908	CAA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016908	ATG	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016908	AGC	2	6	9032	9037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016908	ATA	2	6	9062	9067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016908	CAA	2	6	9137	9142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016908	A	7	7	9168	9174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016908	AAG	2	6	9212	9217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016908	AATTA	2	10	9218	9227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016908	TAA	2	6	9450	9455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016908	AGA	2	6	9534	9539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016908	A	6	6	9601	9606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016908	TAT	2	6	10207	10212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016908	AAC	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016908	TTG	2	6	10321	10326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016908	AAT	2	6	10413	10418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016908	ATC	2	6	10449	10454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016908	GTT	2	6	10469	10474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016908	GGT	2	6	10501	10506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016908	GTA	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016908	ACT	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016908	TTG	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016908	CTT	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016908	TAT	2	6	10749	10754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016908	T	7	7	10770	10776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016908	AAAGAC	2	12	10780	10791	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016908	AGAAT	2	10	10835	10844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016908	A	6	6	10856	10861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016908	ATA	2	6	10870	10875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016908	TAC	2	6	10880	10885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016908	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016908	AAC	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016908	ATT	2	6	10982	10987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016908	TAT	2	6	10998	11003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016908	T	6	6	11021	11026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016908	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016908	A	6	6	11115	11120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016908	TGG	2	6	11159	11164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016908	GAATT	2	10	11191	11200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016908	AGA	2	6	11260	11265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016908	T	6	6	11311	11316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016908	CAT	2	6	11336	11341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016908	TTA	2	6	11375	11380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016908	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016908	ATA	2	6	11443	11448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016908	A	6	6	11485	11490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016908	G	6	6	11491	11496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016908	T	6	6	11647	11652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016908	A	7	7	11680	11686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016908	TA	3	6	12542	12547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016908	TCG	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016908	CGCTC	2	10	12612	12621	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_016908	TTA	2	6	12682	12687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016908	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016908	TAA	2	6	14763	14768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016908	GTT	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016908	GAA	2	6	14802	14807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016908	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016908	GTC	2	6	17901	17906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016908	A	6	6	17948	17953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016908	T	7	7	17969	17975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016908	ATT	2	6	17976	17981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016908	AGAACA	2	12	18062	18073	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016908	T	7	7	18134	18140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016908	TTA	2	6	18148	18153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016908	TTA	2	6	18158	18163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016908	TTA	2	6	18232	18237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016908	T	6	6	18245	18250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016908	A	6	6	18517	18522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016908	A	6	6	18530	18535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016908	A	6	6	18710	18715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016908	AGTA	2	8	18754	18761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016908	ATTA	2	8	18779	18786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016908	ATG	2	6	18801	18806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016908	AAG	2	6	18813	18818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016908	AATA	2	8	18823	18830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016908	CTTT	2	8	18868	18875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016908	ACA	2	6	18918	18923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016908	ATA	2	6	18928	18933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016908	AT	3	6	18969	18974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016908	ATA	2	6	18988	18993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016908	ATA	2	6	19050	19055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016908	TAAA	2	8	19059	19066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016908	GCA	2	6	19071	19076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016908	TAA	2	6	19078	19083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016908	GCT	2	6	19095	19100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016908	AAT	2	6	19189	19194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016908	TAA	2	6	19205	19210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016908	GTA	2	6	19218	19223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016908	ATC	2	6	19233	19238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016908	AGAT	2	8	19247	19254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016908	ATT	2	6	19308	19313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016908	GTA	2	6	19530	19535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016908	TA	3	6	19600	19605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016908	T	6	6	19606	19611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016908	T	6	6	19651	19656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016908	AAT	2	6	19801	19806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016908	AGTA	2	8	19812	19819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016908	AT	3	6	19830	19835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016908	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016908	A	6	6	19872	19877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016908	A	7	7	19880	19886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016908	TTG	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016908	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016908	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016908	ATT	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016908	AT	3	6	20115	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016908	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016908	TTTAA	2	10	20172	20181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016908	TA	3	6	25828	25833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016908	ACTA	2	8	25878	25885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016908	ACC	2	6	25932	25937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016908	TATAA	2	10	25995	26004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016908	AAT	2	6	26012	26017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016908	CAC	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016908	TAC	2	6	26248	26253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016908	AAT	2	6	26389	26394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016908	AT	3	6	26682	26687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016908	CTT	2	6	26717	26722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016908	AAT	2	6	26796	26801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016908	CAAATA	2	12	26895	26906	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_016908	AGT	2	6	26915	26920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016908	A	6	6	26960	26965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016908	TAA	2	6	26979	26984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016908	TAA	2	6	27000	27005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016908	TAAAGT	2	12	27058	27069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016908	AG	3	6	27080	27085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016908	GAT	2	6	28094	28099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016908	GTA	2	6	28166	28171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016908	ATG	2	6	28182	28187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016908	ATA	2	6	28379	28384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016908	TTTAGG	2	12	28436	28447	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016908	TAT	2	6	28523	28528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_016908	ATA	2	6	59274	59279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_016908	TTG	2	6	59326	59331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_016908	ATA	2	6	60030	60035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_016908	TTG	2	6	60608	60613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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